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  • CRISPR Cas9系统中的crRNA和tracrRNA是什么？ - 知乎
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    scaffold: 是比contig还要长的序列，获得contig之后还需要构建paired-end或者mate-pair库，从而获得一定片段的两端序列，这些序列可以确定contig的顺序关系和位置关系，最后contig按照一定顺序和方向组成scaffold，其中形成scaffold过程中还需要填补contig之间的空缺。
  • 什么是sgRNA？ - 知乎
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  • CRISPR Cas9系统中的crRNA和tracrRNA是什么？ - 知乎
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    关于Cas12a crRNA的直接重复序列（DR区或Scaffold区）的具体序列，这个信息可以因物种来源的Cas12a酶而异。 通常，DR序列是crRNA中高度保守的部分，它在生物体的CRISPR阵列中重复出现，分隔每个spacer序列。
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    基因编辑中的sgRNA （单导向RNA）设计是一个关键步骤，尤其在使用CRISPR-Cas9系统时。 sgRNA的设计并不仅仅局限于目标基因要切除部分的PAM（原核抗性矢量辅助模块）序列后面的片段，还包括以下几个关键方面：
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  • DNA是双链的，那么CRISPR-Cas9的gRNA如何跟目的序列 . . .
    尽管DNA是双链结构，gRNA仍然能够与其目标序列互补配对，这一过程主要依赖于以下机制： 单链识别：在CRISPR-Cas9系统中，gRNA设计为与目标DNA的一条链（称为靶链）互补。 当Cas9蛋白与gRNA形成复合体后，这个复合体会在DNA上寻找与gRNA互补的序列。





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